Three bacterial strains were isolated from the activated sludge system of petroleum refinery wastewater, identified by partial sequencing of 16S rDNA, and classified as Acinetobacter genomospecies 3, Bacillus pumilus, and Bacillus flexus. The degradation efficiency of aromatic hydrocarbons was evaluated by gas chromatography with a flame ionization detector. In a mineral medium containing anthracene and phenanthrene and the consortium of microorganisms, the removal efficiency was 96% and 99%, respectively, after 30 days. The good rate of hydrocarbon degradation proves the operational efficiency of the microbial consortium in treating effluents containing these compounds.

O objetivo foi utilizar métodos complementares de diagnóstico (histopatológicos, bacteriológicos e moleculares), no julgamento de lesões suspeitas de tuberculose observadas durante a inspeção post mortem de rotina em abatedouros. Foi acompanhado o abate e a inspeção de 41.193 bovinos, sadios ao exame ante mortem, em sete abatedouros no estado de Mato Grosso. Carcaças de 198 (0,48%) animais apresentaram lesões, sendo 182 (92,0%) classificadas como granulomatosas ou piogranulomatosas na avaliação histopatológica. Entretanto, na baciloscopia, não foi evidenciada a presença de bacilo álcool-ácido resistente (BAAR). Mycobacterium bovis foi isolado em três (1,5%) lesões, provenientes de linfonodos retrofaringeanos de bovinos com até três anos de idade. Quando usado a PCR múltipla (m-PCR) diretamente nos fragmentos de tecido, detectou-se a presença de DNA de M. bovis em 14 (7,0%) lesões, incluindo as três amostras identificadas na análise bacteriológica. O julgamento das lesões pelo exame macroscópico concordou em 93,0% (184/198) com os resultados obtidos por meio da PCR. A fim de evitar equívocos durante a avaliação, principalmente das lesões paucibacilares, como as encontradas neste estudo, recomenda-se a utilização de testes complementares rápidos e confirmatórios. A m-PCR, associada à inspeção post mortem de rotina, demonstrou ser uma técnica promissora para a vigilância da tuberculose bovina em abatedouros, contribuindo para o sucesso do programa de erradicação da tuberculose bovina.

The aim of this study was used diagnostic methods (histopathological, bacteriological and molecular) in the trial of suspected tuberculosis lesions observed during routine post mortem inspection in abattoirs. A total of of 41,193 cattle, which appeared healthy in ante mortem examination, slaughtered in seven abattoirs in the state of Mato Grosso, Brazil were examined. The carcasses of 198 (0.48%) animals showed lesions, of which 182 (91.9%) were classified as granulomatous or pyogranulomatous by histopathological analysis. However, at bacilloscopy, the presence of acid-fast bacilli (AFB) was not detected. Mycobacterium bovis was recovered from 3 (1.5%) samples, all from retropharyngeal lymph nodes in cattle up to three years old. When multiplex PCR (m-PCR) was performed directly on fragments of injured tissue, M. bovis DNA was detected in 14 (7.0%) samples including the same 3 bacteriologically positive samples. Evaluation of lesions by macroscopic analysis agreed 93% (184/198) with bacteriological culturing and the molecular test. To avoid misinterpretation during the examination, mainly of paucibacillary lesions such as those found in the samples analyzed, the use of rapid and unequivocal complementary tests such as mPCR is recommended. Molecular diagnosis, combined with routine post mortem inspection, proved to be a promising technique to improve the surveillance of TB in abattoirs, contributing to the success of the bovine tuberculosis eradication program.

O taro (Colocasia esculenta) é uma hortaliça da família Araceae cujo rizoma é o décimo quarto alimento vegetal mais consumido no mundo. Caracterizado como uma hortaliça não convencional, o taro é cultivado no Brasil como uma cultura de subsistência, mas nos últimos anos começou a ser cultivado comercialmente, sobretudo nos estados de Espirito Santo, Minas Gerais e Rio de Janeiro. Para evitar a perda da diversidade genética das variedades locais tradicionalmente cultivadas no Brasil é necessária a manutenção das cultivares em bancos de germoplasma. O objetivo do trabalho foi caracterizar geneticamente as cultivares do taro provenientes do banco de germoplasma do Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural do estado do Espirito Santo (Incaper). Foi extraído o DNA dos tecidos desidratados das amostras de taro e a diversidade genética de sete cultivares foi investigada por PCR utilizando sete pares de iniciadores que detectam polimorfismos do tipo SSR (simple sequence repeats), em sete loci (Xuqtem55, Xuqtem73, Xuqtem84, Xuqtem88, Xuqtem91, Xuqtem97 e Xuqtem110). A diversidade genética das cultivares, com base nos alelos destes microssatélites foi avaliada com o software GelCompar II. Os loci Xuqtem73, Xuqtem88 e Xuqtem110 foram os mais informativos, apresentando 7, 10 e 8 alelos, respectivamente, com 85, 57 e 100% de cultivares com alelos polimórficos e PIC idênticos de 0,91. A análise do polimorfismo do locus Xuqtem110 permitiu o agrupamento das 7 cultivares em dois clusters com características fenotípicas semelhante e permitiu afimar que o clone Chinês originou o clone Chinês Regional Incaper, que por sua vez deu origem à variedade São Bento, corroborando dados da literatura. As cultivares Macaquinho e Chinês podem ser consideradas enraizadoras dos loci analisados, indicando que estas cultivares podem ter originado as cultivares das regiões dos estados de Mato Grosso do Sul e do Espirito Santo.

Taro (Colocasia esculenta) is a tuberous plant belonging to the Araceae family whose tuber is the 14th most consumed food crop in the world. Characterized as an unconventional vegetable, taro is grown in Brazil as a subsistence crop, but in recent years began to gain commercial importance, especially in the states of Espirito Santo, Minas Gerais and Rio de Janeiro. To avoid loss of genetic diversity of the local varieties traditionally grown in Brazil a core collection for taro germplasm has been developed by the Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural do estado do Espirito Santo (Incaper). The aim of this study was to perform a molecular characterization of the seven regional core collections. Genetic diversity of the cultivars was investigated by using SSR (Simple Sequence Repeats) polymorphisms, in seven loci (Xuqtem55, Xuqtem73, Xuqtem84, Xuqtem88, Xuqtem91, Xuqtem97 and Xuqtem110). Genetic diversity of the cultivars, based on the seven microsatellite alleles, was evaluated by using the software GelCompar II, showed that the loci Xuqtem73, Xuqtem88 and Xuqtem110 were the most informative, featuring 7, 10 and 8 alleles, respectively, a percentage of cultivars with polymorphic alleles of 85, 57 and 100% and identical PIC of 0.91. Based on Xuqtem110 locus analysis, the seven cultivars were grouped in two clusters. Chinês Regional Incaper cultivar was originated from Chinês cultivar which originated the São Bento cultivar, corroborating previous results. Macaquinho and Chinês cultivars were shown to be the primitive ones originating the allelic collections found in the states of Mato Grosso do Sul and Espirito Santo.